研究院立足高等教育，聚焦“IT+数媒+健康医疗科技”领域，有效整合学校各类研究资源，搭建理论研究和实践探索平台及对外交流合作平台，培养具有卓越绩效的研究团队，促进学校教学研究、科技研发工作高质量发展。
研究院下设：
智慧健康研究中心：围绕国家“健康中国”发展战略，依托东软大健康产业优势，聚焦智慧康养，重点开展AI+营养、AI+AR/VR/XR+医疗/健康和健康大数据分析等方向的研究。
智慧医学影像研究所：围绕智慧医学科研、专病智能化、医疗过程智能辅助、智慧患者服务以及多模态医学大数据、医学数据结构化等共性关键技术方向开展研究工作。
人工智能研究所：专注于大数据分析、人工智能技术及智能化应用的研究。与产业紧密结合，主要研究方向包括：智慧农业、情感计算、数据可视化、人机交互等。
高等教育研究所：围绕学校建设高水平有特色创业型应用技术大学的办学定位，针对一流应用技术大学的基础理论、重大政策和实践问题展开研究。